Inicjatorem powstania stacji w Międzyzdrojach jest prof. Stanisław Musielak, dyrektor Instytutu Nauk o Morzu na US. Uniwersytet Szczeciński otrzymał po Straży Granicznej obiekt, przy ulicy Gryfa Pomorskiego. Budynek położony na wydmie doskonale nadaje się na działalność stacji morskiej.
Strefa brzegowa południowego Bałtyku jest obszarem odbierającym największe strumienie zanieczyszczeń emitowanych ze źródeł zlokalizowanych w Europie zachodniej i centralnej. Z tych też względów rejon Zatoki Pomorskiej uznaje się za jeden z obszarów o najintensywniejszej akumulacji ładunków zanieczyszczeń, z których część podlega złożonej redystrybucji w ekosystemie przybrzeżnym i częściowej reemisji do powietrza.
Stacja Morska US wesprze lokalne działania na rzecz ochrony środowiska oraz uatrakcyjni lokalną ofertę turystyczną poprzez organizację programów edukacyjnych oraz upowszechnianie wiedzy o funkcjonowaniu strefy brzegowej.